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種々の有毒な生成物（とくに殺虫剤と洗剤）が家庭用として広く無差別に用いられていて、これらの汚染物質が海洋環境に広域的に蓄積される少なからぬ一因をなしていることは明らかであり、それゆえ高い商業的価値を持つ種の資源戯に、かなりの影響を与えるかもしれないということである。
同様にして汚染が漁業生産物に及ぼす間接的作用についても考えてみることができる。
この影響というのは、微生物や化学的汚染物質が海中動物の体内に蓄積および貯蔵されたとき、その動物自体には少なくとも外見上は何の有害な作用も示さないのに、それらの売買や利用を危うくするような傾向のあるすべての現象をひっくるめて言うのである。
この蓄積と貯蔵の現象から、消費者に対していくつかの危険がもたらされるが、その危険とは、汚染物質それ自体が有毒であったり、海産物の風味が損なわれたり、あるいはまた、海産物が異様な姿になってしまったため、消費者の購買欲が減退してしまうことになる。
これまではもっぱら産業的な原因による汚染物質を考察してきたが、それらのほかに都市排水（病院や研究所からの排水を含む）や、集約農業地帯からの排水によっても漁業活動は影響を被る。
なかでも、とりわけ恐ろしく思われるのは家庭から出る汚染である。
そのなかには莫大な病原菌（腸内バクテリア、大便連鎖球菌、チフス菌）が含まれているが、それらのあるものは海中で長期間生き残り、種々の海中動物、とくに2枚貝（カキ、イガイなど）によって浪縮されやすい。
そのわけは2枚貝が漁過によって食物を摂取しすぎたものである。
脂肪に固着する好脂肪物質はこの部門に含まれるが、たとえば有機塩素（蒜物）や炭化水素（海産物に「石油臭」を付与する）などもそうである。
また健康な個体の肉の中には存在せず、人間に対して有毒であるような有機化合物の生合成を促進する物質（水銀化合物の場合）もある。
生活廃棄物による汚染がますます激しくなってくると、沿岸水で行われる貝類養殖業の集約化は、その衛生管理を担当する当局に対して、いっそうゆゆしい問題を提起するようになっている。
貝類の養殖区域では、大腸菌の含有量がしばしば非常に増大し、たいへん多くの病原菌（サルモネラ菌、大便連鎖球菌、腸内ウイルス）がとくに強い抵抗力を持つことが知られている。
これらの病原体はきわめて容易に貝類（カキ、イガィ）に蓄積する。
衛生管理局は疫病を防ぐための措置として、やむをえず貝類養殖場を不定期間閉鎖したり、あるいはこれらの動物を自然の繁殖区域で採取することを禁止したりする。
しかし実際には、これらの処置をほどこしたとしても、多かれ少なかれ密漁が行われたりするので、実際の採取鍬が目立っては減らないことが多い。
沿岸の羅緋は直接的な都市汚染または川を仲介とする都市汚染のためにしばしば閉鎖されることがある。
このように貝類の採取が禁止されるのは、たいていは暑い季節のあいだじゅう、あるいは激しい雨が降って養殖場に大北の汚水がもたらされたときである。
食用2枚貝の場合には、食用に供する前に洗浄用水槽内の生賛に入れて、体内や貝殻の中の水に蓄職した病原菌を吐き出させる必要がある。
このような洗浄用水楠付きの養殖場は、今日ではすっかり完成しており、フランスは海洋漁業科学技術研究所の努力によって、この分野における先頭的な地歩を占めるに至っている。
この表題が表すものは、食用にされる無脊椎動物や魚が作る毒素のことである。
この毒素によって、人間が病気になったり、中毒にかかったりするので、その結果、海産物を利用することができなくなる。
これらの物質はきわめて多種多様であって、その効果が長いあいだ認められてきたにもかかわらず、性々にして、化学的性質はおろか、しばしばその正確な発生源さえ知らずにいる物質もある。
たとえば熱帯地方では、魚類や無脊椎動物によって起こる「シガテラ」と呼ばれる中赤現象が見出されてから4世紀になんなんとしている。
シガテラの毒素は、熱帯および亜熱帯の海に生息する非常に多くの生物（植物、無脊椎動物、魚類）に認められている。
中毒の重さとその時間的・地理的な分布の様子はきわめて変化に富んでいる。
しかしながら、シガテラのタイプの中毒は海の汚染とは直接には何の関係もないように思われる。
とはいえ、以前には人川が希薄であった地方に「文明」が入り込み、生活様式の発展とともに古来の伝統的な様式が失われていくにつれて、この中毒はますます頻繁かつ深刻なものになっていくように見える。
海産物による人間の中毒のもう一つの例は、種々の貝類によって生じるもので、これは熱帯の海でよく知られている。
この毒性は貝類が非常にしばしばゴニオラックス首と呼ばれる有毒の渦鞭毛藻類を吸収する事実と関係がある。
このことは長いあいだ疑問視され続けてきたが、今川では渦鞭毛藻類に含まれる毒素は、海中動物のあるものを殺すに十分なほど強いことが知られている。
たとえばヴィーナスガィ恵曽の（ハマグリの類）やザルガイは直接的作用を受けるし、イカナゴは毒を蓄秋した無脊椎動物を餌にすることによって間接的作用を受ける。
それとは別の海産動物、たとえばイガィやホタテガイなどの2枚貝は毒素を蓄積しても、自分自身は病気にかからないでぴんぴんしており、それを食べた海鳥や人間がひどい中議にかかって落命する例が少なくない。
渦鞭毛藻類が大量発生すると、通例は海の色が変色する。
この大量発生の現象は、環境要因に関係するいくつかの特別な条件が一つに結びついたときに、自然に発生する現象である。
しかしながら、汚染の問題を論ずる場合には、この現象を考慮する必要がある。
というのは、このような植物が突発するのは、少なくとも部分的には、水中の栄養無機塩またはいくつかの化学的要因の含有蛍が、一時的に異常になることと明らかな関係があるからである。
ところで、生活排水と縁が深い沿岸地方の一つの特色は、確かにそのような塩が豊富に存在することであり、しかもそれぞれの塩の含有量は、通常の海水中に含まれる含有量とは著しく異なっていることが多い。
この変色水の現象は、以前では温帯地方の海ではまれであったが、ここ10年ほどは〔1979年時点からさかのぼって〕、とくに夏のヨーロッパ沿岸でも頻繁に見られるようになったことは否定しがたい。
こうした状況はきわめて憂慮すべきことであり、熱汚染の悪化がそれに拍車をかけているのである。
熱帯地方での生物稚性の原因を決定することは、徹底的な研究に値するものである。
その理由は動物性タンパク源がしばしば不足する国々においては、その究明は国際的機関によって行われる綿密な漁業発展計画のなかで、かなりの重要性を占めるからである。
それだけでなく、もしも専門家たちが広域的な生態学的平衡を管理することができないとすると、あるいは少なくとも、人間の食用になる種につながる食物連鎖と直接関係した平衡の部分を管理できないとすると、海中養殖の可能な試みは決定的な危険に直面することになる。
直接には食用としない多くの魚類から、濃縮タンパクをこの例としておそらく最も有名なものは、すでに述べた日本の水俣病であろう。
その発生源は塩化ビニールエ場の水銀で汚染された排水であった。
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